В научно-исследовательской работе принимает участие весь профессорско-преподавательский состав кафедры под научным руководством зав. кафедрой, профессора М.Р. Сапина.

Основным направлением НИР сотрудников кафедры является «Исследование строения и микротопографии иммунных структур и желез в стенках полых внутренних органов у человека в норме и у животных в условиях воздействия факторов внешней среды».

В публикуемых ежегодно работах сотрудники кафедры представляют новые научные данные, необходимые для понимания особенностей строения иммунной системы и механизмов иммунной защиты у человека и в экспериментах у животных, а также о вариантах строения, возрастных и половых различиях малых желез.

Представленные научные данные имеют не только большое теоретическое, но и практическое значение для клинической иммунологии, хирургии, гинекологии, также при гигиеническом нормировании предельно допустимых концентраций (ПДК) различных химических веществ и различных факторов внешней среды.

В научных работах использованы новые условия и вещества, воздействующие на иммунный статус как организма в целом, так и его отдельных органов (тимус, селезенка, лимфатические узлы, аппендикс, иммунные структуры пищеварительной системы, трахеи, бронхов и некоторых других органов). Новые данные о морфо-функциональных особенностях желез расположенных в слизистой оболочке внутренних органов, что расширило наши представления о микротопографии и структуре железистого аппарата. Разработанные и изданный тесты и ситуационные задачи по всем разделам анатомии внедрены в учебный процесс во многих медицинских вузах РФ.

Ежегодно публикуется до 50 и более научных работ, а также учебная литература. Так, в 2004 году опубликовано 59 статей и тезисов (в том числе 8 за рубежом), 2 монографии, 5 учебников и учебных пособий, 6 учебно-методических сборников.

В 2004 году под руководство зав. кафедрой профессора Сапина М.Р. защищено 3 докторских и 1 кандидатская диссертация. Под руководством профессора Никитюка Д.Б. – 1 кандидатская диссертация.

Научно-исследовательская деятельность студентов (членов СНК).

В научном кружке кафедры ежегодно занимается от 120 до 150 студентов 1, 2, 3 и старших курсов академии.

Заседания СНК проводятся ежемесячно с обсуждением устных и стендовых докладов на различные темы, многие из которых имеют анатомо-клиническую значимость. Ежегодно студенты готовят 95 – 125 рефератов и более 100 стендовых сообщений.

Студенты участвуют также в ежегодных институтских и межвузовских конференциях. Научные работы студентов публикуются в «Сборниках научных студенческих работ» и в морфологических журналах, в том числе в соавторстве с научными руководителями.

Организуются экскурсии студентов-кружковцев в НИИ трастплантологии, институт мозга.