Кафедра глазных болезней является одной из старейших кафедр страны. В Московском университете чтение лекций по офтальмологии началось с 1805 года, дисциплина эта читалась в соединении с хирургией, так как профессор Гильдебрандт одновременно вел курс хирургии и глазных болезней. Теоретический курс глазных болезней был невелик и читался в летние месяцы, больных было немного, поскольку хирургический институт был открыт только на шесть коек. Профессор Гильдебрандт читал лекции до 1830 года. После него преподавание глазных болезней вел доктор медицины А.Е. Эвениус до 1846года. С 1836 года началось самостоятельное преподавание офтальмологии. В качестве клинической базы главным образом служила Глазная больница на Тверской улице, основанная в 1826 году. Для того времени это была большая и хорошо оборудованная больница. Во главе ее стал опытный офтальмохирург и общественный деятель П.Ф.Броссе. в 1836-1837 гг. офтальмология читалась на IV курсе 3 раза в неделю по 2 часа в течение одного семестра. В 1846 году в связи с новым уставом создана новая кафедра госпитальной хирургии и офтальмиатрии, преподавание офтальмологии вел экстаординарный профессор П.Ф.Броссе. Он был первым историографом отечественной офтальмологии.

В 1846-1847 учебном году теоретическую хирургию с офтальмологией преподавал студентам III –IV курсов в обоих полугодиях ректор университета ординарный профессор Альфонский. Профессор П.Ф.Броссе преподавал «Практическое учение о распознавании и лечении глазных болезней» на V курсе. В 1860 году в Московском университете впервые была открыта самостоятельная кафедра офтальмологии. В качестве исполняющего должность экстраординарного профессора был назначен доктор Юнге, но он был переведен на кафедру офтальмологии в Петербургскую медико-хирургическую академию и до 1863 года кафедра оставалась вакантной. В 1863 году кафедру возглавил главный врач московской глазной больницы профессор Г.Н. Браун, который руководил кафедрой до 1892 года. Московская глазная больница стала центром теоретического и практического преподавания офтальмологии. 4 ноября 1892 года при Московском университете была открыта глазная клиника. С этого времени кафедра офтальмологии перешла в собственное помещение на Девичьем поле. В этом же году было открыто глазное отделение в Екатерининской больнице, которой руководил профессор А.А. Крюков. Оснащение и оборудование клиники на Девичьем поле было самым современным. В 1897 году в клинике проходил XII Международный съезд врачей-офтальмологов. Руководителем кафедры глазных болезней на Девичьем поле был назначен профессор Алексей Николаевич Маклаков. Крупный ученый, шедший своими оригинальными путями в науке, А.Н. Маклаков, был признанным руководителем московской школы окулистов того времени.

В прекрасно оборудованной и богато оснащенной клинике на Девичьем поле при профессоре А.Н.Маклакове, как и при ближайшем преемнике, профессоре А.А. Крюкове (1895-1908гг), велась большая научная и практическая работа. Профессором А.Н. Маклаковым было изобретено много ценных офтальмологических приборов. Им предложен в 1884 году апланационный тонометр для измерения внутриглазного давления, который применяется и в настоящее время, а принцип его действия используется в современной тонографии. В 1866 году в 27-летнем возрасте А.Н Маклаков защищает диссертацию на степень доктора медицины на тему «О травматическом воспалении сетчатой оболочки». А.Н. Маклаков много работал над проблемой глаукомы. Им разработаны важнейшие направления физиотерапии глаза, впервые проведена фистулизирующая антиглаукомная операция, разработаны методы массажа глаза, большое внимание уделялось профессиональным заболеваниям органа зрения. Работы А.Н. Маклакова были чрезвычайно важны, имя его получило мировую известность. А.Н.Маклаков был не только ученым с мировым именем, он активно участвовал в ряде научных медицинских обществ в России и за границей, организовывал Пироговский съезд в Москве, учредил Московское хирургическое общество.

В 1895 году после смерти А.Н. Маклакова руководство кафедрой перешло к профессору А.А. Крюкову. Адриан Алесандрович Крюков был крупнейшим деятелем отечественной офтальмологии, им опубликовано много оригинальных статей по различным отделам офтальмологии. В 1884 году создан журнал «Вестник офтальмологии» при активном участии профессора Крюкова А.А., который с 1904 года стал его редактором. Большое участие принял А.А. Крюков в создании Московского общества глазных врачей, которое возникает в 1887 году из маленького кружка московских окулистов. А.А Крюков заслужил глубокую признательность нескольких поколений врачей как прекрасный педагог. В 1892 году им написан первый учебник по глазным болезням, который выдержал 12 изданий. Под руководством профессора А.А. Крюкова совершенствовалась лечебная работа. В 1901 году была открыта амбулатория в новом помещении, соединенном со стационарными отделениями клиники. С каждым годом увеличивалось количество студентов, резко возрастала обращаемость больных, и благодаря работе амбулатории, студенты получали хорошую практическую подготовку. А.А. Крюков умер в 1908 году. На должность директора кафедры был назначен А.Г. Люткевич, который занимал кафедру в течение года. А.Г. Люткевич активно участвовал в издании журналов «Вестник офтальмологии», «Архив офтальмологии». С 1909 по 1917 гг. кафедрой заведовал профессор А.А. Маклаков, после смерти которого, руководство кафедрой перешло к профессору В.П. Одинцову В.П. Одинцов - прекрасный педагог, талантливый лектор, уделял большое внимание педагогической работе, воспитал коллектив преподавателей, много сделал для оснащения учебного процесса наглядными пособиями, учебниками. В 1919 году были утверждены новые штаты: профессор, доцент, 4 ассистента и 4 ординатора.

В 1936 году вышел в свет новый, написанный В.П. Одинцовым учебник по глазным болезням. В.П. Одинцов совместно с К.Х.Орловым написал и издал исключительное по важности и интересу «Руководство по глазной хирургии». Летом 1939 года после смерти В.П. Одинцова заведование кафедрой перешло его ученику А.Я. Самойлову. Великая Отечественная Война на недолгое время прекратила педагогическую работу кафедры. I ММИ был эвакуирован из Москвы, а глазная клиника обслуживала главным образом раненых. 1 января 1942 года в институте возобновились занятия и на кафедре глазных болезней. В эти военные годы кафедрой руководил старейший преподаватель клиники профессор А.Г.Ченцов. Сроки обучения были сокращены, а программы в соответствии с этим пересмотрены. Педагогическая работа, несмотря на плохие военные условия, никогда не нарушалась и велась на высоком уровне. После окончания Великой Отечественной Войны педагогическая работа кафедры под руководством А.Я.Самойлова значительно расширилась и усложнилась. Число студентов V курса лечебного и санитарно-гигиенического факультетов возросло до 600-700 человек. Занятия проводились по цикловой системе, на лекции отводилось 36 часов (18 лекций), на практические занятия 56 часов. В эти годы кафедра много внимания уделяет методической работе, особенно с молодыми преподавателями, так как к преподаванию стали широко привлекаться ординаторы третьего года обучения. В 1959 году была введена субординатура студентов 6 курса по офтальмологии. Студентов, желающих получить первичную специализацию по глазным болезням, оказалось очень много. Кафедра отдавала много времени и сил для подготовки молодых специалистов. Отмена специализации по глазным болезням привела к тому, что студенты стали активно работать в научном кружке, где они могли овладевать офтальмологией.