Кафедра создана в 1940 году на базе Курса латинского языка, организованного в 1927 году при Кафедре нормальной анатомии 1 ММИ её заведующим (1900-1930) большим знатоком русской и латинской медицинской терминологии проф. Петром Ивановичем Карузиным (1864-1939), взявшим на себя труд и первого преподавателя медицинской латыни.

Первым заведующим кафедры стал известный ещё в дореволюционной России филолог-классик, автор учебников и учебных пособий по латинскому языку для гимназий, доц. Е.М.Арбатский (1872 - 1942), преподававший латынь при кафедре Нормальной анатомии и издавший в 1934 году «Пособие при изучении латинской терминологии для Медвузов и Медтехникумов».